A kerti kakukkfüvet a népgyógyászatban hörghurut, torokfájás, emésztési problémák, gyomor- és bélhurut, hasmenés, ízületi gyulladás, puffadás esetén használják. Alkalmazzák ezeken kívül vizelethajtóként, húgyúti fertőtlenítőként is.